ایشان با اشاره به اختلاف‌ اصل‌دوم کلام امامیه با معتزله گفتند: شیعه براین باور است که دوزخ و بهشت مخلوقند و آنها معتقند که‌ خدا جهنم و بهشت را در آینده خلق خواهد کرد و اختلاف دیگر در مسئله شفاعت است و معتزله قائل به شفاعت برای مؤمنین و باعث علو درجه هستند و ما شفاعت را برای گنهکاران و پاک شدن آن از اعمال زشت و ناپسند می‌دانیم البته نه هر گنهکار؛ بلکه کسی که رابطه روحی و ایمانی با خدا و پیامبر و ائمه علیه السلام داشته باشد و شفاعت برای اسقاط عذاب بوده و از اختراعات اسلام نیست بلکه در آیین یهود ومسیح وجود داشته است.
این مرجع تقلید با بیان این که معتزله قائل به حبط اعمال هستند گفتند: یعنی اگر کسی غیبت کرد تمام اعمال آن دیگر مورد قبول خداوند تبارک وتعالی نیست و ما امامیه می‌گوییم حبط اعمال فقط در یک مورد و آن برای کسی که از دین خارج شود.
ایشان با اشاره به این که مکتب معتزله اهل غلو هستند و در حجیت عقل اصلاً حساب و کتابی در بین آنها وجود ندارد ابراز کردند: ما در کلام امامیه عقل را حجت می‌دانیم اما برای آن دایره خاصی قائل هستیم که همان حسن و قبح عقلی است.
این مدرس خارج فقه و اصول حوزه علمیه قم با اشاره به این که برای عقل قلمرو خاصی وجود دارد و آن حسن و قبح عقلی به فرق مستقلات عقلیه با غیر مستقلات عقلیه پرداختند و اظهار داشتند: در مستقلات عقلیه صغری و کبری عقلیه اما در غیر مستقلات عقلیه صغری شرعی و کبری عقلی است.
ایشان با بیان ششمین اختلاف در کلام امامیه با معتزله تصریح کردند: شیعه معتقد است که اگر کسی توبه کرد بر خدا لازم نیست که توبه او را بپذیرد؛ ولی معتزله بر این باورند که بر خداوند واجب است که توبه انسان را قبول کند.
حضرت آیت الله سبحانی گفتند: امامیه معتقد است که انبیاء نسبت به ملائکه از برتری برخوردارند؛ ولی مکتب معتزله این اعتقاد را قبول ندارد و دلیل مکتب امامیه این است که ملائکه قدرت بر معصیت ندارند در حالی که در انبیاء توانایی معصیت هست و انسانی که قدرت بر معصیت دارد و گناه نکند به مراتب بالاتر است.
ایشان اظهار داشتند: مکتب امامیه قائل به اختیار انسان«لا جبر و لا تفویض امر بین الامرین» در این عالم است اما معتزله می گوید خداوند امور را به دست خود انسانها سپرده است و با اعتقاد به این مطلب خواسته‌اند خداوند را تنزیه کنند اما از طرف دیگر با این کار خود قدرت خداوند تبارک و تعالی را محدود کرده‌اند.
این مرجع تقلید با اشاره به اعتقاد مکتب امامیه که معتقدند در بدو خلقت بشر که انبیاء نبودند عقل به تنهایی کافی نبود گفتند: براساس مکتب امامیه تنها انبیاء می‌توانند ما را متوجه عالم بالا و پایین کنند و با وجود آنها عقل کار ساز می‌شود؛ ولی معتزله قائل به این هستند که خود فرد همه راه‌ها را به تنهایی بدون انبیاء می‌تواند طی کند.
ایشان با اشاره به این که امامیه معتقد به معصوم امام امت هستند اظهار داشتند:  معتزله بر این اعتقادند که جانشین بعد از پیغمبر می‌تواند معصوم نباشد و رهبری امت را بر عهده بگیرد. و در مسئله امر به معروف و نهی منکر امامیه آن را واجب سمعی می‌دانند ولی معتزله قائل به واجب عقلی هستند و امر به معروف و نهی از منکر در یک‌جامعه‌ای که زندگی می‌کنیم باید باشد چون سرنوشت فرد بستگی به‌سرنوشت جامعه دارد و فرد را از سرنوشت جامعه نمی‌توانیم جدا فرض کنیم.
حضرت آیت الله سبحانی با اشاره به آخرین اختلاف کلام امامیه و معتزله که اگر مرتکب به گناه کبیره توبه نکند گفتند: امامیه براین باورند کسی که گناه کبیره انجام دهد و اگر توبه نکند مخلد در آتش جهنم نیست ولی آنها می گویند مرتکب کبیره اگر توبه نکند تا ابد جایگاهش آتش جهنم است.
این مرجع تقلید در پایان تأکید کردند: امامیه در کلام خود مستقل است و وامدار اشاعره و معتزله ‌نیست و از قرآن، سنت،‌ خطبه‌های امیرمؤمنان و عقل کمک گرفته است.